Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI1Q9ULC6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms