Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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