Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABCF2Q9UG63 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms