Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms