Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms