Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REREQ9P2R6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms