Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms