Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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HOXC10Q9NYD6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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HOXC10Q9NYD6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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HOXC10Q9NYD6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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