Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms