Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms