Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms