Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACKR4Q9NPB9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms