Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-5Q9HDB9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms