Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD34

LYRM4, LYR motif-containing protein 4, humanhuman

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM4Q9HD34 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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LYRM4Q9HD34 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYRM4Q9HD34 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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