Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F12Q9HCS2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms