Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ELL3Q9HB65 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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