Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms