Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms