Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms