Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABARAPL3Q9BY60 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABARAPL3Q9BY60 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABARAPL3Q9BY60 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABARAPL3Q9BY60 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms