Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRRTQ9BXP5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRRTQ9BXP5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRRTQ9BXP5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRRTQ9BXP5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRRTQ9BXP5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRRTQ9BXP5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRRTQ9BXP5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms