Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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