Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms