Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms