Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms