Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAF2Q96CS3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms