Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPUSD4Q96CM3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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