Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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GTF3C6Q969F1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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GTF3C6Q969F1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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GTF3C6Q969F1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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GTF3C6Q969F1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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GTF3C6Q969F1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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GTF3C6Q969F1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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GTF3C6Q969F1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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GTF3C6Q969F1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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GTF3C6Q969F1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
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GTF3C6Q969F1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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