Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRG4Q92954 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms