Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms