Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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