Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCG3Q8WXD2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms