Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD22

SFXN5, Sideroflexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN5Q8TD22 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SFXN5Q8TD22 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.5 ms