Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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TTC21AQ8NDW8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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TTC21AQ8NDW8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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TTC21AQ8NDW8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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TTC21AQ8NDW8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TTC21AQ8NDW8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TTC21AQ8NDW8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TTC21AQ8NDW8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TTC21AQ8NDW8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
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TTC21AQ8NDW8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TTC21AQ8NDW8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC21AQ8NDW8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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