Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms