Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS3Q8IXF0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms