Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM48Q8IWZ4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms