Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC103Q8IW40 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC103Q8IW40 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms