Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HAPLN4Q86UW8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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