Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT28Q7Z3Y7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms