Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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