Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUPD1Q68J44 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms