Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms