Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms