Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KHDC3LQ587J8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms