Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms