Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CFAP221Q4G0U5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms