Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q499Y3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q499Y3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q499Y3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms