Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms