Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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